O CEFH pretende investigar, numa perspetiva interdisciplinar, as relações entre Natureza, Pessoa e Sociedade, no contexto das novas conceções do ser humano e das relações interpessoais que emergem das ciências cognitivas. A Unidade integra as contribuições das áreas de Filosofia, Linguística, Ciências da Comunicação, Estudos Literários e Psicologia e promove o diálogo entre algumas das principais tradições filosóficas (e.g. fenomenologia, filosofia da religião, filosofia da natureza, filosofia da mente) e as atuais ciências cognitivas.

O CEFH explora três tópicos de investigação da relação do indivíduo com os outros e com o mundo: (1) processos causais, sistemas complexos e emergências; (2) ecologias do humano: identidade, alteridade, felicidade; e (3) cognição, intersubjetividade e desenvolvimento humano. Assumindo o princípio experiencialista da cognição corporizada, estes temas são estudados como expressões simbólicas do cérebro/mente corporizado e enativo.

• Promover, coordenar e apoiar projetos de investigação nas áreas da filosofia, a linguagem e ciências da comunicação, os estudos literários, e a psicologia;
• explorar, numa perspectiva multidisciplinar, as relações entre Individuo e Sociedade, nas suas dimensões filosóficas e éticas, linguísticas e comunicativas, culturais e literárias, psicológicas e educacionais;
• investigar de que modo o pensamento humano é determinado pela nossa corporização orgânica e pelas nossas experiências individuais, sociais, culturais e históricas;
• argumentar, com base em evidências filosóficas, linguísticas, literárias e psicológicas, como pensamento e racionalidade, linguagem, poesia, imaginação, cultura, memória, perceção ou emoção são "produtos" das mentes colectivas situadas nos seus contextos físicos, sociais, culturais e históricos;
• aplicar os resultados da investigação fundamental aos contextos educativo, artístico, sanitário e médico, bem como às tecnologias da informação e da comunicação;
• apoiar a formação de investigadores de doutoramento e de pós-doutoramento nas áreas científicas com as quais o Centro está envolvido;
• promover o intercâmbio com outras instituições científicas e culturais em Portugal e no estrangeiro;
• organizar e colaborar em congressos, simpósios, colóquios, seminários, cursos especializados, reuniões científicas e ciclos de conferências;
• promover e apoiar a publicação dos resultados da investigação realizada.